萌學(xué)園，傳說成立的時間是在地球誕生的年代，是一所由夸克族人組成的魔法學(xué)校，隱藏在地球大氣層外平行空間里，并由現(xiàn)任萌騎士幻之星（李昂霖飾）、炎之星（劉書宏飾）、智之星（林奕勛飾）、十之星（阿本飾）、月之星（彩虹飾），代代相傳，守護地球的和8090電影。在一次搶救魔法生物的任務(wù)中，意外引來宇宙中的黑色力量莫爾斯（傅冠杰飾），威脅萌騎士交出磐古，召喚出萌學(xué)園的過去，否則將用魔法抽干地球水資源，讓所有生命干涸而死！磐古，究竟是什么？為了拯救地球，萌騎士踏上尋找磐古的旅程，竟發(fā)現(xiàn)磐古的神秘力量與自己的魔法有著密不可分的連接結(jié)，然而要付出什么代價才能阻止莫爾斯奪走磐古？與萌騎士一起面對跟地球共存亡的關(guān)鍵戰(zhàn)役！

萌騎士團與阇黑大戰(zhàn)之后的半年，隕石突然飛向萌學(xué)園，彗星小組卻察覺萌騎士隊長艾瑞克竟隨著隕石掉落到萌學(xué)園！大甜甜教員立刻展開治療駛卷使微弱的艾瑞克，并聯(lián)絡(luò)夸特諾基地的陶格長老幫6080yy。相同，謎亞星卻掉落在地球上的夸特諾基地，產(chǎn)生魔法反轉(zhuǎn)的奇異現(xiàn)象。透過大甜甜與亮晶晶的聯(lián)絡(luò)，艾瑞克得知謎亞星掉落在夸特諾基地，急切想知道找尋萌騎士團下落，但又察覺本人身體里產(chǎn)生奇怪的能量，艾瑞克失控了！